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本生選購指南:如何選擇PCR實驗耗材?
關(guān)于其基因組的測序和信息分析,早在兩年前就由華大基因、浙江大學(xué)和中國科學(xué)院的科學(xué)家團(tuán)隊共同合作完成。后續(xù)功能的驗證主要包括PCR檢測、ChIP、IP、IHC、IF、FISH等手段。而其中就簡單的方式就是PCR驗證,那關(guān)于PCR實驗有哪些影響因素呢?
我們一般想到的可能是獲取的DNA/RNA質(zhì)量、反轉(zhuǎn)錄的效率、引物的特異性乃至DNA聚合酶的保真度、擴(kuò)增長度等問題,但很少有人會想到耗材的選擇,可能也會影響您的實驗結(jié)果。那么關(guān)于PCR實驗耗材我們改如何選擇呢?
首先需要明確的是我們做的是哪種PCR實驗。根據(jù)檢測方法的不同,PCR實驗分為普通PCR法和熒光定量PCR法,前者一般是終點PCR跑膠法測定,所以在選擇耗材時需要關(guān)注的主要是耗材本身的導(dǎo)熱性和密封性;而后者是實時檢測熒光信號,除了導(dǎo)熱性和密封性外,對透光性和避光性也有所要求。換句話而言,可以做熒光定量PCR的耗材一定可以來做普通PCR,反之,效果卻會差很多!
確定好了實驗類型,我們就可以選擇耗材了,如前面所述,我們知道了密封性、導(dǎo)熱性、透光性、避光性等因素是我們需要關(guān)注的,那為什么要關(guān)注這些呢?
一、密封性
密封性越好,產(chǎn)物的揮發(fā)越少,得到的產(chǎn)物就越多同時氣溶膠的產(chǎn)生也越少,對于下一輪實驗的污染也就越少,也就意味著假陽性的產(chǎn)生率越低。
二、導(dǎo)熱性
導(dǎo)熱性越好越均一,PCR的速度就越快,準(zhǔn)確度也越高。
三、透光性
這主要是對于熒光定量而言,我們知道它是一種實時定量的方式,那么耗材本身的透光性就直接關(guān)系到我們檢測到的熒光信號多少,如果選擇耗材透光性不足,本該檢測到的信號檢測不到,那就會造成我們對結(jié)果的誤判。
四、避光性
這也是針對熒光定量而言的,同上面的因素,如果我們在整個實驗過程中沒注意避光,帶有熒光的試劑過度被消耗,那*直接就會影響我們實驗的擴(kuò)增效率,導(dǎo)致不準(zhǔn)確的結(jié)果產(chǎn)生。
PCR單管
采用的一次注塑成型技術(shù),超薄設(shè)計,熱傳導(dǎo)快,視窗比平面低,不易被劃擦,管子密封性更好,近乎零蒸發(fā),減少了氣溶膠的污染,*大程度避免了假陽性的產(chǎn)生。熒光系列,蓋子高度透光,可適用于頂讀與低讀。
八聯(lián)管(適用普通PCR)
低于平面的高透視窗設(shè)計,可以*大程度避免被劃擦。100%進(jìn)口的原材料的使用使得管壁具有均一的平整和穩(wěn)定的不黏壁性,確保了樣品處理和吸取時的精準(zhǔn)度。
PCR板
不同于市面上其他廠家底部注塑的方式,注塑點是在板面上的孔與孔的交叉處,這樣使得PCR板的管底與PCR儀的接觸更好,同時采用純度高達(dá)99.9%的聚丙烯,超薄設(shè)計、壁厚一致均勻的工藝使得熱傳導(dǎo)精確、控溫準(zhǔn)確、有效減少了實驗循環(huán)時間。
RNasin 能夠保護(hù)mRNA 的完整,有利于提高轉(zhuǎn)錄及翻譯的效率,同時避免了使用有機(jī)化合物抑制劑可能帶來的影響。
規(guī)格:30μl(40U/μl)
RNasin 是存在于人胎盤中的一種特異性核糖核酸酶(RNase)抑制劑其本質(zhì)是蛋白質(zhì),分子量為51,000 Da,等電點pH值為4.7。
RNasin能夠特異地與RNase 以非共價鍵結(jié)合形成復(fù)合體從而使RNase 失活。RNasin在緩沖液為0-0.5M NaCl,pH5-8的條件下具有活性,pH7.8 時活性最高。
RNasin 能夠保護(hù)mRNA 的完整,有利于提高轉(zhuǎn)錄及翻譯的效率,同時避免了使用有機(jī)化合物抑制劑可能帶來的影響。
產(chǎn)品特點:
RNasin 能夠抑制真核生物的RNaseA、B、C 和人胎盤RNase 的活性。
該產(chǎn)品不抑制RNase H,S1核酸酶,SP6,T7 和T3RNA聚合酶,MV 或M-MLV 反轉(zhuǎn)錄酶,Taq DNA 聚合酶,
RNase T1,不影響后繼的反轉(zhuǎn)錄及蛋白質(zhì)翻譯過程。
緩沖體系需要有1 mM DTT 存在,活性pH 范圍寬廣。
產(chǎn)品應(yīng)用:
用在有潛在RNase 污染的地方。
在cDNA合成、體外轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)、翻譯系統(tǒng)中保護(hù)mRNA。
可以增加多核糖體的活性、產(chǎn)量;利于病毒的體外復(fù)制。
用于制備無RNase 的蛋白產(chǎn)品,如抗體。
本生選購指南:如何選擇PCR實驗耗材?本生生物公司供應(yīng):ELISA試劑盒,動物血清,熒光定量PCR耗材,移液器吸嘴,微量離心管,進(jìn)口凍存管,細(xì)胞培養(yǎng)皿,培養(yǎng)板,培養(yǎng)瓶,進(jìn)口吸頭,儀器及手套,色譜耗材,針頭過濾器等。
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